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总体目标: 将分区域逐层拍摄的生物样品图像进行拼接和3D重建,实现三维可展示效果
要求:
1. 该算法可以被软件调用,执行
2. 代码规范清晰明了,便于后续开发
3. 算法中的变量参数设置允许用户在使用中自己修改
关键内容:
1. 图像预处理
图像降噪,图像去雾化(遮挡产生),图像去卷积(当前方法,或考虑双螺旋点扩散函数),图像去背景(Rolling ball)及亮暗调整
2. 3D重建
3D重建后的图像要便于展示查看,改变视角,放大缩小,推进退出等,支持时序展示(若太复杂或工作量成本太高可取消时序展示),支持或者可以生成视频
3. Z轴投影
逐层图像的Z轴投影和时序展示
4.分层切片影像总数几千层或以上(越多越好,但要考虑可行性和是否增加工作量成本)
最终效果要求:
1. 图像预处理效果
1.1 当前去背景处理(rolling ball),去卷积处理已经基本满足需要。
请考虑去卷积部分采用双螺旋PSF去卷积的方法比较一下,最后择优。如果新的方法不比当前的更好,可以保留当前方法
1.2 去遮挡与去雾化,达到当前处理的效果,见图 “神经”/“细胞”
“根”的效果是重点,需要再共同确认。(可以用上述方法处理一张表层的结构图象,作为参照)
2. 三维重构效果
见视频展示“脑血管”
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